科教网| 中国科教第一门户网
当前位置:   首页 > 整合医学 > 正文

张培震 地震动力学家 中科院院士

整合医学
来源: 标签:中科院院士地震 2014-08-26 14:39:08
水稻基因组与遗传学家。中国科学院上海生命科学研究院/国家基因研究中心研究员。1963年4月15日出生于安徽省阜阳市,籍贯安徽太和。1985年毕业于安徽师范大学,1988年在广西农学院获硕士学位,1992年在英国John Innes Centre/The Sainsbury Laboratory获博士学位。

韩斌 科技世界网

水稻基因组与遗传学家。中国科学院上海生命科学研究院/国家基因研究中心研究员。1963年4月15日出生于安徽省阜阳市,籍贯安徽太和。1985年毕业于安徽师范大学,1988年在广西农学院获硕士学位,1992年在英国John Innes Centre/The Sainsbury Laboratory获博士学位。现任中国科学院上海生命科学研究院副院长。

从事水稻基因组、群体遗传学、全基因组关联分析及栽培稻的起源和驯化等研究工作。率先完成了水稻第四号染色体精确测序及着丝粒序列结构分析。成功开展了基于全基因组测序分析的水稻复杂性状全基因组关联分析和转录组分析。克隆和鉴定了水稻芒长等驯化相关基因,系统鉴定了水稻全基因组驯化选择位点,证明了亚洲栽培稻粳稻为单起源于中国珠江流域并经过第二次驯化产生籼稻,解开了水稻驯化和起源之谜。

韩斌研究员主要的研究方向是水稻基因组测序、比较基因组学研究和水稻功能基因组学研究。在过去的几年里,他和他的实验室构建了水稻四号染色体的物理图谱,并在此基础上完成了水稻四号染色体的精细测序和分析,同时开发了覆盖水稻四号染色体的芯片并用它鉴定了四号染色体上基因的表达模式。以上的这些成果发表在《自然》、《基因组研究》和《植物细胞》等杂志上。在最近的几年里,他和他的实验室开始利用新一代测序技术开发高通量的基因分型平台和转录组分析平台,并在此基础上研究水稻基因组的遗传变异,进行重要农艺性状相关基因的遗传定位,系统分析和鉴定水稻基因的转录本及表达模式。以上的这些成果发表在《自然遗传学》和《基因组研究》等杂志上。在韩斌研究员获得过多项奖项和荣誉中,最主要的是2007年国家自然科学二等奖。

1、水稻4号染色体精细物理图的构建及基因组精确测序

通过整合分子标记、克隆末端序列、DNA指纹等数据,运用分子、染色体荧光原位杂交和比较基因组分析的方法,构建了粳稻4号染色体高精确度和高覆盖率(98.7%)的物理图。鉴定了4号染色体的物理长度以及物理图距和遗传图距的对应关系。基于染色体精细物理图,采用克隆连克隆法的基因组测序方法,完成水稻4号染色体的精确测序和分析。研究成果发表在2002年11月21日出版的Nature上。

之后继续承担了水稻全部12条染色体着丝粒序列和结构的分析,以及籼、粳稻全基因组序列比较,直到2005年国际水稻基因组测序计划完成。


2、水稻4号染色体结构及功能的深入研究

在精细物理图构建和精确测序的基础上,突破了拼装高度重复序列的技术难题,成功鉴定了覆盖着丝粒区域的大片段克隆,完成了序列测定和组装。发现水稻4号染色体着丝粒核心区是由近360个高度重复的特异序列组成,并将这些重复序列组装成18个串联式重复区段,还在该区域鉴定一些编码基因。

在精确测序的基础上,研制了水稻4号染色体的覆瓦式排列的特异芯片,并通过芯片杂交分析,开展了籼、粳稻基因比较表达谱分析和转录调控因子的研究。鉴定了水稻4号染色体上一批新的表达基因,比较了籼粳基因功能和调控方面的差异。得出了水稻染色体上相邻排列的基因有很高的协同表达调控特征等重要结论。还印证了之前对4号染色体基因分布规律的推测结果。


3、比较基因组和功能基因组研究

通过对籼、粳稻基因组的比较分析,系统鉴定了籼粳之间序列多态性分布和频率。随着水稻基因组精确测序的完成,建立水稻转基因实验室,建设了一定规模的温室和试验田。高通量研究水稻基因功能,对一万多条籼稻全长cDNA进行了克隆,测序和分析。同时,通过比较基因组学研究了转座子突变可能对水稻基因功能分化产生的影响。结合基因家族的比较分析和表达组、转基因、过表达等功能分析,发现了一系列在水稻抗热,抗旱和抗盐生理过程中起重要作用的基因。


4、建立以第二代测序仪为基础的高通量功能基因组研究平台

最近,新一代DNA测序方法的诞生标志着生命科学技术的又一次飞跃,为大规模发现和利用水稻遗传资源开辟了有效的新途径。这种新方法集低时耗、高性价比、高密度和高精度等众多优点于一身。采用这一方法完成了一组籼、粳稻重组自交系的基因型鉴定,与目前广泛应用的分子标记相比,新方法在速度和精度上有了大大提高。其精度是之前传统的方法手段无法实现的。

同时尝试的高通量功能基因组研究的新技术还包括表达组和染色质免疫沉淀测序。迅速、大量地鉴定覆盖全基因组的单核苷酸多态性,全面深入掌握我国水稻资源的遗传多样性。

稿件发布与内容纠错:18309209791

行风监督电话:15529092222

创意策划与直播服务:15667159999

违法与不良信息举报:kjw@kjw.cc 029-89696369

回顶部
关于我们| 网站地图 | | 新浪微博| 全国地市频道加盟热线:15529092222

Copyright © 2018 科教网(中国)All rights reserved   陕ICP备18015870号-1

科教网 - 中国科教产业第一门户网