国务院机构改革方案中的首要内容是国务院组成部门调整，首先列出的是组建自然资源部。

具体内容如下：将国土资源部的职责，国家发改委的组织编制主体功能区规划职责，住建部的城乡规划管理职责，水利部的水资源调查和确权登记管理职责，农业部的草原资源调查和确权登记管理职责，国家林业局的森林、湿地等资源调查和确权登记管理职责，国家海洋局的职责，国家测绘局的职责整合，组建自然资源部，作为国务院组成部门，自然资源部对外保留国家海洋局牌子。

不再保留国土资源部、海洋局、国家测绘地理信息局。