《意见》指出，要建立党组织参与决策和监督、有效发挥作用的制度机制，推行党组织与行政领导班子成员双向进入、交叉任职，健全议事决策制度和沟通协调机制。各级党委教育工作部门或教育行政部门党组织要加强对中小学校党建工作的指导、督促和检查，做到与教育教学业务同部署、同落实、同考评。

《意见》明确，要做好发展党员和党员教育管理工作，创新党组织活动内容方式，强化党务工作者培训和激励，把党组织工作融入学校教育教学各项工作中，防止“两张皮”。要把抓好学生德育工作和教职工思想政治工作作为中小学校党组织的重要任务，使德育工作融入学生日常学习生活，促进全员、全过程、全方位育人，引导教职工增强政治认同和教书育人责任感。

此外，《意见》还特别提到，要注重将人财物等资源向农村偏远地区和党建基础薄弱的中小学校倾斜。要加强中小学党建工作基础保障，中小学校要根据办学规模、党员人数等，设立党组织工作机构，配强工作力量。