甘肃省重大疾病防治取得明显进展，建设完成了全省乡镇卫生院传染病疫情和突发公共卫生事件网络直报系统，传染病和疫情网络直报率达到100%。

　　甘肃省的疫情监测能力不断提升，全省感染禽流感、手足口病、甲型H1N1流感、流脑、乙脑、菌痢、病毒性腹泻、炭疽、出血热等重点传染病的防控工作成效明显。全省共建立国家流感监测网络实验室16个、流感监测哨点医院19个。艾滋病、乙肝的防治工作大力开展，儿童计划免疫“七苗”接种率以乡为单位达到95%以上，15岁以下儿童乙肝疫苗补种、甲型H1N1流感疫苗接种、地震灾区甲肝和乙脑疫苗群体性接种工作顺利完成。继续巩固无脊灰状态。

　　同时，对心脑血管疾病、肿瘤等慢性病、职业病防治和精神卫生纳入政府工作规划。肿瘤、精神卫生等慢性非传染性疾病防治都有了不同程度的进展。口腔疾病综合干预全面实施。全省各级医疗机构进一步加强公共卫生职能工作，普遍成立了公共卫生科，积极探索疾控机构进医院的工作方式，开展了健康教育、免疫规划、疾病谱排序等相应工作。